Lo Studio Teologico Accademico presso il Seminario Maggiore di Bressanone si rifà al regolamento degli studi per la formazione presbiterale del Concilio di Trento (1545-63). In seguito al sinodo diocesano del 1603, che con i suoi intenti innovativi applicò i decreti del Concilio di Trento nella diocesi di Bressanone, il 19 novembre 1607 fu fondato il Seminario Maggiore. Trovò sede inizialmente in un edificio annesso al chiostro, l’odierno “Cassianeum”, finché negli anni 1764-72 fu eretta sull’Isola di S. Croce la costruzione barocca che ospita il Seminario, con la grande biblioteca fronteggiante la chiesa. 
Negli anni seguenti ebbero luogo diverse ristrutturazioni e ampliamenti, l’ultimo dei quali negli anni 1988-1990 per dare spazio alla Biblioteca moderna, allo Studio Teologico Accademico e alla Scuola diocesana di Musica Sacra.